L’investissement de la municipalité dans la gestion de son patrimoine archéologique depuis le début des années 1970 conduit à la création, en 1989, du Service Archéologique de la Ville d’Autun. L’archéologie autunoise dispose désormais d’une structure administrative propre et indépendante du musée Rolin pour accompagner les nombreux projets d’aménagement du territoire, qui se développent à l’intérieur de la ville antique, mais aussi dans sa périphérie.
Le Service Archéologique de la Ville d’Autun est placé sous la direction de P. Chardron-Picault qui poursuit l’œuvre de ses prédécesseurs en fouillant aux côtés des archéologues de l’Association pour les fouilles archéologiques nationales (Afan) un grand nombre de sites qui ont fait date dans l’histoire de la recherche : les fouilles de « maison des Auteurs grecs », de la clinique du Parc, de la rue aux Raz ou encore du lycée militaire peuvent être citées à titre d’exemple. L’équipe du Service Archéologique de la Ville d’Autun est alors très réduite, composée de l’archéologue municipal épaulé par un adjoint technique.
Le Service Archéologique de la Ville d’Autun s’installe en 1997 au sein du Centre d’archéologie et du patrimoine Alain Rebourg, d’anciens haras municipaux du XVIIIème siècle réhabilités à l’initiative de la ville d’Autun et du ministère de la Culture. L’équipe s’étoffe progressivement à partir du début des années 2000 et est aujourd’hui composée de quatre archéologues aux missions complémentaires.
